看着儿子们含着眼泪点头答应，藤原衡秀便很放心地撒手人寰了。
然而，事情的发展并没有如衡秀想的那样，他死后半年不到，文治四年（1188）二月，后白河法皇派遣钦差前往平泉传达征讨源义经的旨意。虽然藤原一族非常坚决地抗旨不尊，但由于参谋藤原基成（藤原泰衡的外公）为公卿贵族之后，素与朝中公卿相善，因此朝廷方面仍有不少公卿庇护藤原氏。
10月12日，源赖朝一看软的不行便来了一手硬的，遣使警告藤原一族若不征讨源义经则将获罪株连，而且幕府方面也已准备自行发兵伐罪。
文治五年（1189）二月，在源赖朝的授意下，后白河法皇下旨免除了一批藤原氏族亲的官位，并且向奥州藤原家下达了最后通牒：若是不跟随镰仓幕府一起铲除源义经，那么从即刻起你们便是朝敌国贼，全天下共讨的对象。
已经被各种压力折磨得快要得抑郁症了的藤原家当主藤原泰衡为了挽救逐渐陷入孤立无援的藤原一族，终于决定讨伐源义经。
