除了这些大的形势上的困境之外，朱元璋还面临着部分地主阶级和下层平民对其身份的质疑和不认同，尤其是江南地区的人们，此前这片区域是由张士诚统治的，而且张士诚还治理得不错，因而当地不少民众认同张士诚，这令在江南地区建都的朱元璋很不放心。民间传闻，朱元璋曾微服到京城之中行走，竟然听到一老太太在和他人交谈时称自己为“老头儿”，不由勃然大怒，紧急召唤维持地方治安的军官质问道：“张士诚当年窃据江东，吴地的老百姓们现在还称呼其为张王。如今我是天子，这里的人们却叫我老头儿，这是为何呢，看不起我朱元璋吗？”当场下令对这一事件进行严查，既然皇帝都发话了，那必须要给个交代啊，于是官兵便展开了一轮轰轰烈烈的大清查，这导致许多百姓被当成歹人，因此被抄家示众。还有就是当年朱元璋因“淮西女人好大脚”的灯谜，直接在上元节（即元宵节）的第二天将可能涉及这则灯谜的居民全部斩杀殆尽。尽管上面这两则故事都充满戏剧性，很难让人相信这是真实发生过的。但是这两则故事却都出自明代士大夫之手，也在一定程度上反映了当时的社会现实，即明初的社会矛盾是相当激烈的。