王祯《农书》有两个非常突出的特点。首先，对农业做了比较全面而系统的论述。在《农桑通诀》部分中，总论农业上一系列的问题，并随时注意各问题之间的相互关系。唐宋以前，南方尚没有农书出现，而北方农书由于受历史条件限制，也未能将南方农业的内容写入。所以，这个时候，并没有一本能够统筹南北方农业知识内容的农业书籍。而之后魏贾思勰所著具有农业全书性质的《齐民要术》，也仅仅是涉及黄河中下游一带，而且主要是分别叙述各项生产技术，没有系统地总论其中所包含的问题和原理；唐宋以后，随着《耒耜经》和《陈旉农书》等的出现，填补了南方没有农书的空白，但是南方农书从出现时起就以地方性为特色；元代初年的《农桑辑要》的写作，目的是为了指导黄河中下游的农业生产，因而没有把江南地区的水田生产包括在内。
而王祯《农书》弥补了上述农书的种种缺陷。王祯《农书》是第一部兼论南北，企图从全国范围内对整个农业作系统性的讨论，并把南北农业技术及农具的异同、功能进行分析比较的农书。
所以，从整体上来说，王祯《农书》有总论，有各论，系统分明。谷谱的各论比《齐民要术》的分类更明晰，体例更整齐；而且几乎对每一种作物的性状都做了说明，这在古农书中也是创举。此外它又结合《农器图谱》，对农具做了分类，这就使这部书的内容更加全面，体例更加完整。